Mohammad Arsjad Anwar memulai karir akademiknya di Universitas Indonesia sebagai asisten dosen Statistika (1960). Beliau memperoleh gelar MBA bidang Riset Operasi di University of California di Berkeley, Amerika Serikat pada tahun 1966 dan memperoleh gelar Ph.D. di bidang Ekonomi dari Universitas Indonesia pada tahun 1983. Dua tahun kemudian diangkat menjadi Guru Besar Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia (1985).
Selain menjadi dosen di Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia, beliau juga berturut-turut menjabat sebagai Koordinator Penelitian (1970-1973), Wakil Direktur Penelitian (1973-1978), dan Direktur LPEM (1978-1982 dan 1988). -1989), Wakil Dekan Bidang Akademik Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia (1984-1988), Koordinator Program Pascasarjana Ilmu Ekonomi Universitas Indonesia (1984-1995), Direktur Pusat Intra Fakultas Universitas Indonesia (1985-1987), dan Dekan Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia (1988-994).
Pengetahuannya mengenai permasalahan sosial ekonomi Indonesia diperkaya dengan keterlibatannya sebagai anggota Tim Peneliti Kebijakan (1968-1973), konsultan unit litbang, Departemen Perdagangan (1973-1982), anggota Komite Teknis Energi (1977- 1993), anggota utama Tim Nasional Keselamatan dan Keamanan Masyarakat (Wanhankamnas) (1979 -1982), anggota Dewan Riset Nasional (1983-1993), Direktur Pusat Kajian Kebijakan dan Implementasi (1986-1988), Kepala Badan Tim Konsultan Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia untuk Departemen Perindustrian (1987-1993), serta Anggota Dewan Ekonomi Nasional (1999-2001).
Di bidang pemerintahan, pernah menjabat sebagai staf di bawah Wakil Ketua Unit Kebijakan Moneter dan Fiskal Badan Perencanaan Pembangunan Nasional (1967-1968), Staf Ahli Unit Penelitian Ekonomi di bawah Menteri Perencanaan Pembangunan Nasional/Kepala BAPPENAS (1994-1998) dan Wakil Menteri Koordinator Bidang Perekonomian dan Keuangan (1998-2001).