Arianto A. Patunru memperoleh gelar Master of Science dari Department of Economics, University of Illinois at Urbana-Champaign (2000) dengan spesialisasi di bidang Ekonomi dan Ekonomi Kebijakan Internasional. Beliau memperoleh gelar PhD dari Department of Agricultural and Consumer Economics, University of Illinois di Urbana-Champaign (2004).
Semasa menjabat Direktur Lembaga Penelitian Ekonomi dan Sosial, Arianto A. Patunru juga aktif sebagai dosen di Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia. Pada tahun 2012, beliau bergabung dengan Departemen Ekonomi Arndt-Corden, Sekolah Kebijakan Publik Crawford, Universitas Nasional Australia.