Mohamad Ikhsan meraih gelar Master dari Vanderbilt University, Amerika Serikat pada tahun 1991 di bidang ekonomi moneter dan internasional. Pada tahun 1998, ia memperoleh gelar Ph.D di bidang ekonomi dari University of Illinois, dengan spesialisasi Pembangunan dan Ekonomi Internasional.
Beliau pernah menjadi Anggota LP3E – Kamar Dagang (1999-2005), Anggota Dewan Maritim Indonesia (1999-2007), Wakil Ketua Pokja LEMHANAS Ekonomi (2000-2005), Komisaris Independen PT. Indosat (2003-2004), Komisaris PT. Bakrie & Brothers (2006), Komisaris PT. Danareksa (2008), Staf Khusus Menteri Bidang Perekonomian (2004-2009), dan Anggota Dewan Riset Nasional Kementerian Riset dan Teknologi (2004-2009). Terakhir, beliau menjabat sebagai Asisten Khusus Wakil Presiden (2009-sekarang). Pada tahun 2010, Mohamad Ikhsan dilantik sebagai Guru Besar Penuh Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Indonesia.